Dockground

Unbound Docking Decoys Set 2


How this set was generated:

Testing of scoring functions for protein docking requires a set of docking poses for a statistically significant number of protein-protein complexes, with at least one near-native match per complex among the false-positive solutions (decoys). Ideally, the decoys should be spread in space, to avoid bias in testing due to clustering. This decoys set was built from 300,000 docking matches generated by GRAMM scan for complexes from the DOCKGROUND X-ray Unbound Docking Benchmark 4. The dataset for each complex contains one near-native match (acceptable or better by CAPRI criteria) top ranked by shape complementarity only, and 99 incorrect docking matches with ranking similar to the near-native one, maximally spread around the receptor. All matches are unscored and unrefined. There are 2 PDB-formatted files per complex in the dataset: the file ending in u1.pdb is unbound structure of the receptor (larger protein in the pair) and the file ending in u2_decoys.pdb contains 100 positions of the ligand (smaller protein in the pair) separated, similar to NMR files, by the MODEL-ENDMDL tags. The first position in each decoy file is the near-native docking pose.

Protein-protein docking decoys:

Download docking decoys set 2 in a compressed tar archive [size: 856M]


Separately, each decoys set is available in the following table:


Protein-Protein Docking Decoys Set 2
Downloada     Rankb     Ligandc     Interfaced     Bound  
PDB
  Bound  
  chains  
  Unbound1  
  PDB  
  Unbound1e  
  Chains  
  Bound-  
  Unbound  
 RMSD  
  Unbound2  
  PDB  
  Unbound2e  
  Chains  
  Bound-  
  Unbound  
 RMSD  
decoys 31461 13.70 3.63 1ay7 A:B 1gmq A:A 0.47 1btb A:B 1.07
decoys 162891 18.97 3.94 1bdj A:B 1fqw A:A 0.68 1a0b A:B 0.54
decoys 86818 11.47 3.54 1bgx HL:T 1ay1 AB:HL 1.53 1taq A:T 1.36
decoys 50426 9.58 4.55 1buh A:B 1e1x A:A 1.39 1dkt A:B 0.87
decoys 93156 5.73 3.08 1bui AB:C 1rjx AB:AB 1.82 1c77 A:C 1.27
decoys 3807 6.07 2.61 1bvn P:T 1pif A:P 0.50 1ok0 A:T 0.44
decoys 130755 8.04 3.57 1cc0 A:E 1ftn A:A 0.07 1fst A:E 1.09
decoys 36662 3.42 1.46 1clv A:I 1jae A:A 0.50 1qfd A:I 0.88
decoys 106299 12.26 2.67 1de4 AB:CF 1a6z AB:AB 1.62 1cx8 AB:CF 1.68
decoys 196 5.54 2.20 1dfj E:I 1xpt A:E 0.44 2bnh A:I 1.57
decoys 257908 22.41 3.99 1e6j HL:P 1e6o AB:HL 1.27 3nte A:P 3.44
decoys 117415 13.15 3.90 1eer A:B 1buy A:A 2.87 1ern A:B 2.58
decoys 339 9.91 5.61 1ewy A:C 1que A:A 0.99 1qt9 A:C 0.74
decoys 83315 13.08 3.75 1f6m AB:C 1cl0 AB:AB 3.57 1zzy A:C 0.77
decoys 9838 9.22 4.77 1f80 ABC:D 1f7t ABC:ABC 1.58 1hy8 A:D 2.20
decoys 176088 3.58 1.73 1f93 AB:EF 1dcp AB:AB 0.62 1g39 AB:EF 1.96
decoys 254235 7.39 3.33 1fcc AB:C 1h3x AB:AB 1.52 2igg A:C 1.56
decoys 5170 8.42 4.32 1fle E:I 1b0e A:E 0.40 2rel A:I 2.35
decoys 97128 4.51 1.12 1flt VW:X 2vpf AB:VW 0.84 1qsz A:X 1.14
decoys 176650 12.20 3.30 1fq1 A:B 1fpz A:A 0.80 1ykr A:B 2.53
decoys 136451 13.87 3.01 1frt AB:C 3fru AB:AB 0.89 1h3y A:C 2.07
decoys 167266 10.02 2.73 1g6v A:K 3s73 A:A 0.68 1f2x A:K 0.42
decoys 4837 8.70 3.37 1g73 A:C 1few A:A 1.52 2vsl A:C 0.40
decoys 154762 9.51 4.06 1gcq A:C 2vvk A:A 0.65 1gcp A:C 0.99
decoys 96019 12.54 3.12 1gg2 A:B 1git A:A 1.39 1tbg A:B 1.47
decoys 272820 9.68 3.50 1glb GM:F 1bu6 AB:GM 0.66 1f3g A:F 0.42
decoys 142523 9.28 4.43 1gpq AB:C 1xs0 AB:AB 1.18 1aki A:C 0.29
decoys 13 5.73 1.49 1gpw A:B 2a0n A:A 1.14 1kxj A:B 0.63
decoys 189255 4.76 1.43 1he1 A:C 1he9 A:A 0.91 3th5 A:C 0.61
decoys 94310 7.14 2.23 1hia AB:I 2pka AB:AB 1.05 1bx8 A:I 2.05
decoys 685 3.87 1.37 1hja ABC:I 4cha ABC:ABC 0.62 2ovo A:I 0.61
decoys 87711 7.91 2.35 1hyr AB:C 1mpu AB:AB 0.89 1b3j A:C 2.42
decoys 123083 7.20 2.21 1i2m A:B 5cj2 A:A 2.20 1a12 A:B 0.65
decoys 138364 15.71 3.14 1i4e A:B 1p35 A:A 2.51 4prz A:B 0.58
decoys 158670 8.49 2.82 1icf AB:I 1mhw AB:AB 0.34 1l3h A:I 1.78
decoys 237597 8.99 2.97 1im9 ABC:D 1qqd ABC:ABC 0.60 1nkr A:D 1.72
decoys 11980 6.88 3.48 1is7 ABCDEFGHIJ:PQRST 1fb1 ABCDEFGHIJ:ABCDEFGHIJ 0.80 1jg5 ABCDE:PQRST 0.66
decoys 84211 6.95 3.88 1jiw I:P 2rn4 A:I 1.46 1akl A:P 1.01
decoys 27286 10.63 3.53 1jk9 A:B 1f1a A:A 0.74 1qup A:B 2.91
decoys 11975 5.21 1.91 1jtd A:B 1jwp A:A 0.36 3qi0 A:B 0.34
decoys 196369 4.36 2.39 1jzd AB:C 1g0t AB:AB 2.82 1l6p A:C 1.06
decoys 104192 7.64 4.15 1k5g C:A 2ca6 A:C 0.76 1a2k A:A 2.33
decoys 33232 16.67 3.84 1kgy A:H 3etp A:A 2.43 1iko A:H 1.48
decoys 104384 7.82 3.79 1kyo LMNOPQRSTUV:W 1kb9 ABCDEFGHIJK:LMNOPQRSTUV 0.70 3tyi A:W 0.96
decoys 155721 8.11 4.14 1l9j C:HLM 1cxc A:C 0.77 3zuw ABC:HLM 1.39
decoys 57250 19.35 3.98 1lb2 A:B 4bhp A:A 2.74 1coo A:B 2.10
decoys 263302 18.65 3.90 1lfd A:B 1lxd A:A 1.40 4l9w A:B 0.47
decoys 209910 22.11 3.39 1ltx AB:R 1dce AB:AB 1.12 1vg0 A:R 1.49
decoys 65605 3.92 2.17 1lx5 AC:B 1bmp AB:AC 1.09 1bte A:B 1.35
decoys 282313 8.46 4.97 1m63 EF:G 4orb AB:EF 1.07 4n1s A:G 0.66
decoys 271466 6.17 2.86 1mg2 ABEF:C 2bbk ABCD:ABEF 0.47 1bxa A:C 0.55
decoys 38051 4.95 2.03 1ml0 AB:D 1mkf AB:AB 0.77 1dok A:D 1.00
decoys 232371 8.39 3.76 1mq8 A:B 1iam A:A 1.18 1xuo A:B 1.67
decoys 103356 13.64 3.09 1n8o ABC:E 4cha ABC:ABC 1.80 1ifg A:E 1.04
decoys 64807 5.44 3.07 1nb5 AP:I 8pch AB:AP 0.77 1dvc A:I 1.59
decoys 13032 2.15 1.06 1nbf A:D 4m5x A:A 1.72 2znv A:D 1.00
decoys 55139 8.47 3.01 1nql A:B 4uip A:A 4.03 2kv4 A:B 2.58
decoys 28295 15.23 3.80 1nw9 A:B 2jk7 A:A 0.38 1jxq A:B 1.35
decoys 268414 9.81 5.01 1oc0 A:B 4g8r A:A 1.13 3bt1 A:B 0.91
decoys 237502 12.58 1.92 1ofu A:XY 2vaw A:A 0.76 1oft AB:XY 0.74
decoys 112501 22.32 3.71 1p8v A:BC 1m0z A:A 1.00 2od3 AB:BC 0.57
decoys 160690 14.16 3.83 1pvh A:B 1bqu A:A 0.73 1emr A:B 0.86
decoys 38873 11.04 3.45 1qav A:B 1z86 A:A 1.45 1qau A:B 1.29
decoys 148948 21.49 3.76 1r5i ABC:D 3s5l ABC:ABC 1.13 3kph A:D 2.87
decoys 146352 13.37 3.70 1r8s A:E 1u81 A:A 2.88 1r8m A:E 1.31
decoys 282209 8.39 4.84 1rpq A:W 1j86 A:A 0.78 1kco A:W 1.81
decoys 58325 5.34 2.26 1s1q A:B 2f0r A:A 0.73 4pig A:B 0.72
decoys 11566 15.21 3.55 1s78 A:CD 2a91 A:A 0.96 1l7i AB:CD 2.25
decoys 57621 10.38 3.21 1sjh AB:H 4ah2 AB:AB 0.82 3bvz A:H 0.51
decoys 67931 9.88 4.81 1tco AB:C 1aui AB:AB 0.71 1qpf A:C 0.54
decoys 1602 12.80 3.59 1te1 A:B 1om0 A:A 0.41 3wp3 A:B 0.70
decoys 124520 5.57 2.80 1tmq A:B 1jae A:A 0.38 1bip A:B 2.42
decoys 29697 9.86 3.75 1u0n AD:BC 4c2b AB:AD 1.08 1fvu AB:BC 0.81
decoys 107048 10.14 3.97 1uad A:C 1u8z A:A 0.88 1hk6 A:C 1.34
decoys 234014 6.19 2.70 1uug A:B 1lqj A:A 0.60 2zhx A:B 0.59
decoys 100002 9.65 3.36 1v5i A:B 1sup A:A 0.29 1itp A:B 1.58
decoys 170581 10.41 3.58 1v7p AB:C 1ukm AB:AB 0.65 1aox A:C 0.35
decoys 155432 9.63 4.83 1vfb AB:C 1a7n AB:AB 0.56 2fbb A:C 0.68
decoys 43562 7.06 3.09 1vg0 A:B 1ltx A:A 1.48 1vg8 A:B 1.47
decoys 210066 11.51 3.43 1vrs A:D 1jpe A:A 1.01 2fwf A:D 0.66
decoys 192799 11.18 2.65 1w1i AB:E 4a5s AB:AB 0.42 1o5r A:E 0.55
decoys 243159 8.37 3.10 1wej F:HL 3o20 A:F 0.34 1qbl AB:HL 1.00
decoys 47779 9.62 4.53 1wq1 G:R 1wer A:G 0.98 1p2s A:R 0.48
decoys 20539 8.83 4.10 1wrd A:B 2n2n A:A 2.95 1aar A:B 0.61
decoys 92739 9.78 2.98 1x86 A:B 1txd A:A 4.40 3tvd A:B 1.50
decoys 126479 7.91 4.10 1xk4 AB:D 1mr8 AB:AB 0.68 1irj A:D 0.70
decoys 33381 5.49 2.20 1xt9 A:B 2bkq A:A 1.56 2ko3 A:B 1.05
decoys 294769 11.22 2.36 1y8r AB:C 1y8q AB:AB 2.71 1a5r A:C 2.31
decoys 19581 15.62 3.86 1y8x A:B 4p5o A:A 0.64 2lq7 A:B 2.37
decoys 257551 9.88 3.78 1ycs A:B 4kvp A:A 0.44 4a63 A:B 1.13
decoys 89221 2.79 0.89 1yu6 A:C 1be8 A:A 0.32 2gkr A:C 0.75
decoys 77918 11.48 3.53 1yvb A:I 3bpf A:A 0.49 1cew A:I 1.79
decoys 67415 9.29 4.76 1z5y D:E 1l6p A:D 1.16 2b1k A:E 1.06
decoys 121553 8.45 2.98 1zlh A:B 1cpx A:A 0.39 2jto A:B 3.05
decoys 190724 9.69 5.41 1zud 13:4 1zfn AB:13 0.60 1f0z A:4 1.74
decoys 226854 9.79 3.45 2a1t ABCD:RS 4p13 ABCD:ABCD 0.69 2a1u AB:RS 3.83
decoys 102390 6.15 1.76 2a41 B:A 3dni A:B 1.09 1o18 A:A 0.82
decoys 159869 9.29 4.59 2a5d A:B 2j5x A:A 0.56 1s5f A:B 2.15
decoys 192807 11.17 3.22 2a9k A:B 1u90 A:A 0.61 1uzi A:B 0.95
decoys 30319 14.10 3.89 2abz C:A 1dtv A:C 1.46 7cpa A:A 0.35
decoys 65685 9.89 5.30 2aq3 H:G 1ste A:H 1.19 2apb A:G 0.99
decoys 134361 9.47 5.43 2b4s D:C 2z8c A:D 1.24 1g1f A:C 0.93
decoys 164819 10.04 3.53 2bcg G:Y 3cpi A:G 1.78 1yzn A:Y 1.93
decoys 57257 6.64 2.56 2bcn B:C 1csu A:B 0.51 4jb4 A:C 0.31
decoys 60858 15.27 3.78 2bov A:B 1u8z A:A 0.44 1gzf A:B 1.13
decoys 272372 23.46 2.55 2bq1 EF:IJ 1peu AB:EF 0.87 1r2f AB:IJ 0.59
decoys 78469 4.73 1.52 2bwe T:D 2bwf A:T 0.44 2bwb A:D 0.57
decoys 51334 14.19 2.98 2c0l A:B 1fch A:A 1.32 1qnd A:B 2.56
decoys 194141 7.32 2.60 2c2v B:C 3hcu A:B 0.82 2hlw A:C 1.61
decoys 194111 8.81 4.53 2ch4 A:W 1b3q A:A 3.05 1k0s A:W 2.50
decoys 145109 8.22 2.43 2d5r A:B 4gmj A:A 1.10 2z15 A:B 0.54
decoys 245961 13.71 3.12 2dd8 HL:S 2g75 AB:HL 4.24 2ghv A:S 2.51
decoys 288062 12.41 3.52 2ejf A:C 2zgw A:A 1.16 2d5d A:C 0.40
decoys 26042 9.11 2.70 2g45 A:B 2g43 A:A 1.29 3h7p A:B 0.82
decoys 95065 5.94 2.28 2gj7 AB:F 5d4q AB:AB 1.00 2giy A:F 0.24
decoys 26775 4.04 1.59 2grx A:C 1qjq A:A 0.57 1u07 A:C 0.92
decoys 20192 13.28 3.76 2gwf A:B 1whb A:A 1.48 2fzp A:B 0.44
decoys 245084 12.46 3.67 2h1l ABCDEF:O 1n25 ABCDEF:ABCDEF 1.99 2ocj A:O 1.52
decoys 22975 9.77 3.63 2hj9 B:C 1jx6 A:B 0.75 2hje A:C 0.84
decoys 18265 9.29 4.70 2hqs A:H 1c5k A:A 1.69 1oap A:H 0.59
decoys 166231 10.54 2.91 2hrk A:B 2hra A:A 1.03 2hqt A:B 0.64
decoys 34159 9.84 3.97 2i25 L:N 2d4k A:L 0.34 2i24 A:N 1.03
decoys 234702 10.00 3.90 2ido A:B 1j53 A:A 0.57 1se7 A:B 3.46
decoys 64760 14.92 3.91 2ijo AB:I 3E+090 AB:AB 1.05 3ldj A:I 0.33
decoys 297225 9.76 4.09 2iwt A:B 2vlu A:A 0.52 3bx1 A:B 1.24
decoys 122380 9.99 4.86 2j12 ACE:B 3qnd ABC:ACE 0.69 1eaj A:B 0.90
decoys 175684 3.96 0.98 2nqd A:B 2nnr A:A 0.80 3k24 A:B 1.01
decoys 37396 23.24 3.65 2nxn A:B 2zbp A:A 1.41 2klm A:B 3.99
decoys 271175 22.76 3.31 2o25 A:D 1yla A:A 1.00 1u9b A:D 0.60
decoys 128286 10.19 2.51 2o2v A:B 1wi0 A:A 1.28 2jrh A:B 1.65
decoys 178278 9.87 4.30 2o3b A:B 1zm8 A:A 0.38 1ktu A:B 3.45
decoys 259122 28.55 3.81 2o8v B:A 1xob A:B 0.79 1sur A:A 0.87
decoys 17893 7.91 3.45 2oob A:B 2jnh A:A 1.45 5af5 A:B 0.31
decoys 184873 9.72 3.68 2pu9 AB:C 1dj7 AB:AB 0.70 1f9m A:C 1.04
decoys 22196 12.25 3.81 2qyi C:D 3rxb A:C 0.34 1xg6 A:D 1.33
decoys 289339 11.16 3.53 2rii AB:X 4xcs AB:AB 1.90 1yzs A:X 1.72
decoys 147179 2.92 0.72 2sge E:I 2qa9 A:E 0.56 2ovo A:I 0.46
decoys 30482 9.46 4.47 2uy7 A:B 1qpp A:A 1.46 5flu A:B 3.32
decoys 198027 9.16 2.63 2v55 A:B 4w7p A:A 1.28 1m7b A:B 0.63
decoys 256678 4.90 1.92 2vdb A:B 2bxi A:A 1.84 2j5y A:B 0.60
decoys 239952 18.55 3.40 2vrr A:B 1a3s A:A 0.60 2mw5 A:B 2.37
decoys 17008 9.20 2.36 2wbw A:B 1uxa A:A 0.57 1f5w A:B 0.89
decoys 2662 7.78 3.91 2wy7 A:Q 1c3d A:A 0.67 2jvh A:Q 2.54
decoys 82887 9.59 3.75 2wy8 A:Q 2xqw A:A 0.49 2jvh A:Q 2.55
decoys 21015 8.10 2.06 2x0b E:F 2bks A:E 0.05 2wxw A:F 1.84
decoys 1994 8.24 4.27 2x9a C:D 2x9b A:C 0.57 1s62 A:D 2.38
decoys 64763 14.03 3.97 2xgy A:B 2xgu A:A 1.41 3odi A:B 0.32
decoys 204855 8.80 4.22 2xwb F:J 2ok5 A:F 2.79 1dic A:J 0.63
decoys 217940 12.68 3.93 2xz1 AB:C 4v0j AB:AB 0.64 2fve A:C 1.36
decoys 39580 8.49 2.84 2yvj AP:B 2gr2 AB:AP 0.93 2e4q A:B 0.51
decoys 201941 15.39 3.48 2zae A:B 1v76 A:A 0.86 1x0t A:B 1.13
decoys 284985 11.63 3.90 2zu0 AB:C 1vh4 AB:AB 0.75 2d3w A:C 2.42
decoys 194634 33.31 3.91 2zvn A:BD 2w9n A:A 1.35 3f89 AB:BD 1.71
decoys 48594 10.62 3.92 3a1p A:B 2dyi A:A 2.87 1qkh A:B 2.66
decoys 159599 5.93 2.27 3a8i A:E 1vlo A:A 0.74 3a7l A:E 1.01
decoys 6075 9.02 4.18 3av0 A:B 4tui A:A 1.18 3auy A:B 3.91
decoys 213555 14.81 3.83 3bh6 A:B 4zi2 A:A 0.46 2bx6 A:B 0.75
decoys 164335 9.81 5.23 3bk3 AB:D 3bmp AB:AB 0.88 2mbk A:D 2.42
decoys 228378 7.32 3.66 3bp8 AB:C 1z6r AB:AB 2.75 3bp3 A:C 0.66
decoys 293694 8.11 3.54 3bs5 A:B 3bs7 A:A 0.50 2ean A:B 1.45
decoys 22265 11.20 2.66 3bx1 A:C 4cg0 A:A 0.32 2iwt A:C 1.32
decoys 88116 10.04 3.84 3bx7 CD:A 3osk AB:CD 1.51 3bx8 A:A 0.99
decoys 7512 12.88 3.44 3cbk A:B 3ai8 A:A 1.35 2nnr A:B 0.69
decoys 55056 8.64 3.47 3cii ABC:GH 3bze ABC:ABC 0.98 3bdw AB:GH 0.84
decoys 254318 13.81 2.76 3cu1 D:C 2uus A:D 1.27 3caf A:C 0.45
decoys 240806 15.20 3.46 3cvh ABC:HL 3p9l ABC:ABC 0.82 3cvi AB:HL 1.21
decoys 262821 14.37 3.79 3cw2 A:K 2plf A:A 2.19 2nxu A:K 4.76
decoys 153790 9.18 2.49 3d3c A:J 1ey1 A:A 3.01 2kvq A:J 0.69
decoys 46141 7.51 3.47 3d5o ABCDE:F 2a3x ABCDE:ABCDE 1.37 1h9v A:F 1.09
decoys 804 2.36 1.01 3d5r A:C 2xqw A:A 0.46 2gom A:C 0.43
decoys 162993 5.43 1.92 3daw A:B 2hmp A:A 1.01 2hd7 A:B 1.50
decoys 55678 4.12 2.06 3e2l A:C 2ov5 A:A 0.34 3gmu A:C 0.80
decoys 4425 8.55 2.72 3f1p A:B 1p97 A:A 1.58 1x0o A:B 1.63
decoys 223355 6.88 4.73 3f7p A:C 1mb8 A:A 1.23 3f7q A:C 1.84
decoys 87409 5.74 3.00 3fap A:B 1fkj A:A 0.52 1aue A:B 0.70
decoys 118931 20.47 3.58 3fn1 A:B 2lq7 A:A 1.91 2edi A:B 1.34
decoys 203013 9.94 5.27 3fpu A:B 3fpt A:A 1.42 4ra8 A:B 1.67
decoys 233507 4.69 1.31 3g3a A:B 3g39 A:A 0.60 1hsw A:B 0.56
decoys 5014 19.16 3.83 3g6d A:HL 1ga3 A:A 2.72 3g6a AB:HL 4.05
decoys 22300 7.44 3.81 3ge3 ABCDFG:H 3rmk ABCDEF:ABCDFG 0.95 2bf2 A:H 1.59
decoys 95479 20.29 3.85 3hi6 B:XY 1cqp A:B 1.47 3hi5 AB:XY 2.72
decoys 251669 13.52 3.77 3hzi A:C 3dnt A:A 0.88 4yg4 A:C 0.30
decoys 32126 11.26 3.85 3k1i A:D 3iqc A:A 0.70 3k1h A:D 1.17
decoys 35816 14.40 3.86 3k9m A:C 3ai8 A:A 1.85 1dvc A:C 1.71
decoys 124258 14.52 3.40 3kld A:B 3jxa A:A 2.26 3jxg A:B 0.95
decoys 84932 9.04 2.49 3l1z A:B 3l1y A:A 1.35 2kr4 A:B 1.34
decoys 206514 9.64 4.88 3l4q A:C 3o9t A:A 1.10 3mtt A:C 2.34
decoys 151974 8.39 4.06 3l5n AB:M 2i07 AB:AB 4.01 2qff A:M 0.68
decoys 195663 5.67 2.23 3l89 ABC:M 3l88 ABC:ABC 0.58 1ckl A:M 3.93
decoys 280364 7.09 3.54 3lb8 A:C 1q1w A:A 0.63 1xlo A:C 0.68
decoys 28194 9.39 4.36 3ltf AC:D 3i2t AB:AC 3.50 3ca7 A:D 0.74
decoys 183238 6.37 2.32 3lvj AB:C 3lvm AB:AB 0.55 1dcj A:C 1.26
decoys 266824 8.33 2.56 3lwn A:F 3tvd A:A 1.36 3lyq A:F 1.46
decoys 7779 7.42 3.38 3m18 A:B 3m19 A:A 0.88 1ved A:B 0.30
decoys 250111 12.28 2.22 3mj7 A:B 3mj6 A:A 1.14 3j6o A:B 0.08
decoys 273002 24.91 3.74 3mj9 A:HL 3mj6 A:A 1.41 3mj8 AB:HL 3.97
decoys 181617 6.64 2.35 3mxw A:HL 4c4m A:A 1.05 3mxv AB:HL 1.09
decoys 192559 6.22 2.12 3mzw A:B 2a91 A:A 1.17 2kzj A:B 1.17
decoys 200488 9.59 4.11 3oed A:C 1c3d A:A 0.50 1ly2 A:C 0.98
decoys 56775 9.56 3.82 3oj4 A:B 2c4p A:A 0.66 4pqt A:B 0.52
decoys 166299 9.17 3.87 3ona A:B 3on9 A:A 1.01 1b2t A:B 0.98
decoys 94637 4.13 2.33 3onl A:C 3onk A:A 0.81 3onj A:C 0.99
decoys 169882 11.88 2.80 3oun A:B 3poa A:A 0.27 3otv A:B 0.68
decoys 251690 9.58 3.92 3p11 A:HL 1m6b A:A 2.11 3p0v AB:HL 0.76
decoys 6840 7.33 2.30 3pnl AC:B 3pnk AB:AC 0.95 2btd A:B 0.43
decoys 72599 9.30 3.49 3pro A:C 8lpr A:A 0.29 2pro A:C 1.86
decoys 11812 9.44 4.62 3prp A:B 3phu A:A 0.79 1d3z A:B 0.71
decoys 1714 9.95 4.01 3pv6 A:B 3pv7 A:A 1.09 3noi A:B 1.33
decoys 41123 9.80 5.06 3qc8 A:B 3qq7 A:A 1.54 3qx1 A:B 0.56
decoys 42014 10.30 3.67 3qlu A:C 3om1 A:A 1.59 3h6h A:C 1.10
decoys 253673 18.34 3.99 3r66 AB:C 1xeq BA:AB 1.55 1z2m A:C 2.20
decoys 167381 5.70 2.73 3r9a AC:D 4i8a AB:AC 0.71 1fch A:D 1.11
decoys 9281 10.96 3.19 3rj3 A:D 1c3d A:A 0.41 3r62 A:D 1.34
decoys 37752 6.28 2.49 3rnk A:B 3sbw A:A 1.11 3bov A:B 1.58
decoys 221234 9.91 3.75 3rrm AB:C 3rrn AB:AB 2.78 1xip A:C 0.59
decoys 13757 10.23 3.95 3rvd ABCD:I 3k2b ABCD:ABCD 0.44 2lj9 A:I 1.44
decoys 22161 5.40 2.01 3s36 HL:X 3s34 AB:HL 0.96 3s35 A:X 0.62
decoys 114002 5.58 1.93 3s3x ABC:F 2qts ABC:ABC 1.12 2kni A:F 1.18
decoys 287392 14.28 3.37 3s5l ABC:G 1dlh ABC:ABC 1.11 3cd4 A:G 0.99
decoys 141241 25.67 3.83 3sjv DE:FGH 3skn AB:DE 1.16 1m05 ABC:FGH 1.28
decoys 16207 9.15 4.01 3t1q A:BC 3t1o A:A 1.48 3t1r BA:BC 1.18
decoys 231833 17.13 3.93 3t5g A:B 1xtr A:A 1.07 5e8f A:B 0.63
decoys 232805 5.68 1.73 3tg1 A:B 3p79 A:A 1.23 2ouc A:B 1.43
decoys 4097 15.78 3.73 3uai ABC:D 3u28 ABC:ABC 1.20 3uah A:D 0.74
decoys 172354 3.59 1.24 3ulq A:B 4i9e A:A 1.85 2krf A:B 1.85
decoys 81836 5.81 2.04 3vlb A:B 3vla A:A 1.19 3vl8 A:B 0.71
decoys 73390 11.16 2.87 3vxu ABC:DE 3vxo ABC:ABC 0.76 3vxt AB:DE 0.66
decoys 261190 14.31 3.93 3w31 A:B 3w30 A:A 1.20 4onn A:B 1.42
decoys 204133 3.15 1.31 3wkt A:C 3es9 A:A 1.40 1dve A:C 0.54
decoys 273451 20.79 3.35 3wwk AB:C 3bx4 AB:AB 1.05 2c6u A:C 0.38
decoys 242729 9.98 4.61 3wwn AC:B 3wwm AB:AC 1.35 3wwl A:B 1.92
decoys 170161 4.85 2.34 3zn6 A:BD 3zmn A:A 0.88 3zn5 AB:BD 1.45
decoys 250909 11.35 1.59 3znz A:B 3znv A:A 0.98 2w9n A:B 0.46
decoys 75962 3.56 1.29 4bi8 A:B 3zfi A:A 0.39 4bi3 A:B 0.87
decoys 263342 10.22 3.23 4bmp A:B 4bmq A:A 0.90 2x2o A:B 0.35
decoys 2155 4.23 1.61 4bos A:E 4boq A:A 0.95 4y1h A:E 0.80
decoys 74018 3.20 1.50 4boz A:B 4boq A:A 0.80 1d3z A:B 0.89
decoys 182814 11.25 3.65 4bws AB:C 4bwq AB:AB 0.32 1gyf A:C 1.21
decoys 224029 5.62 2.94 4c0o A:C 4c0p A:A 2.97 2o3d A:C 1.71
decoys 221507 7.93 1.67 4c6t A:B 4c6s A:A 0.92 4c6r A:B 0.65
decoys 196104 9.14 4.59 4cpa A:I 1iy7 A:A 0.40 1h20 A:I 1.39
decoys 212559 31.50 3.82 4ct4 A:B 4gml A:A 1.66 4ct5 A:B 1.19
decoys 1919 8.77 3.23 4cu4 A:B 2fcp A:A 0.46 1pp5 A:B 1.75
decoys 51621 3.83 1.62 4di3 ABC:E 3u64 ABC:ABC 0.91 3u65 A:E 1.41
decoys 277747 16.97 3.74 4dn4 HL:M 4dn3 AB:HL 3.32 1dok A:M 0.94
decoys 64290 11.42 2.76 4dss AC:B 4dsr AB:AC 0.44 2fa4 A:B 0.41
decoys 191576 5.68 2.60 4e2i ABCDEF:1 1svm ABCDEF:ABCDEF 0.78 2keb A:1 1.43
decoys 96054 1.50 0.74 4ejx A:BD 4enz A:A 0.82 1mhl AB:BD 0.48
decoys 250160 5.18 2.50 4emj A:B 4emi A:A 1.00 3dqy A:B 0.57
decoys 233640 10.38 1.98 4etq C:HL 4e9o A:C 0.75 4ebq AB:HL 0.53
decoys 55187 9.27 3.70 4etw A:B 1m33 A:A 0.80 2fad A:B 0.98
decoys 193664 4.97 2.08 4ext A:BC 2lsg A:A 1.61 3abe AB:BC 1.54
decoys 281103 8.04 2.13 4f7g A:B 1mix A:A 1.33 2kbb A:B 1.73
decoys 237159 13.60 2.39 4fa8 ABCDHI:FG 2ch8 ABCDEF:ABCDHI 0.71 3uf2 AB:FG 0.86
decoys 10879 6.24 2.09 4fi3 ABCD:F 4r9u ABCD:ABCD 1.21 1n2z A:F 1.46
decoys 291238 3.42 1.25 4fme A:B 4fma A:A 1.16 3nkv A:B 0.93
decoys 232138 22.90 2.60 4fqr ABCDEF:ef 4fnk ABCDEF:ABCDEF 0.40 4fnl AB:ef 1.41
decoys 98554 9.76 3.41 4ged A:B 3riv A:A 0.32 4dy9 A:B 0.48
decoys 203057 5.41 2.98 4gmj A:B 4gml A:A 0.83 2d5r A:B 1.11
decoys 105544 10.84 2.96 4goj A:C 1fzq A:A 2.22 3rbq A:C 1.41
decoys 227423 7.40 3.36 4gxu ABCDEF:QR 2wrg ABCDEF:ABCDEF 0.88 4gxv AB:QR 3.68
decoys 296241 20.08 3.70 4h8w G:HL 4dkp A:G 0.53 3tnn AB:HL 2.62
decoys 271313 4.28 1.88 4hcn A:B 3gqm A:A 0.64 2jwz A:B 1.79
decoys 59177 11.18 3.22 4hh3 AB:C 4l9g AB:AB 4.81 4heh A:C 1.00
decoys 263755 12.67 3.69 4hmy AB:C 1w63 AB:AB 3.66 1o3y A:C 0.88
decoys 207801 8.15 2.30 4hqp ABCDE:G 3sq9 ABCDE:ABCDE 0.87 1kfh A:G 2.14
decoys 291206 9.49 3.71 4hre C:EFGH 2hyw A:C 0.70 4hrh ABCD:EFGH 1.01
decoys 54949 10.58 3.39 4hx3 BD:C 4hwx AB:BD 1.22 1kuh A:C 0.57
decoys 181886 7.40 3.17 4i5l AC:B 2ie3 AB:AC 4.45 4mew A:B 2.32
decoys 183578 10.22 3.95 4icg AB:D 1ni8 AB:AB 1.37 1jw2 A:D 1.83
decoys 290250 10.82 3.81 4ihf DEF:G 3eh0 ABC:DEF 1.79 2fad A:G 0.79
decoys 154967 20.57 3.43 4ilh A:B 3e9p A:A 1.81 3sbs A:B 1.79
decoys 1659 12.40 3.55 4j38 A:B 2m4f A:A 1.49 2xqw A:B 1.13
decoys 30931 11.06 3.94 4j4l A:C 3rfs A:A 1.88 1alu A:C 1.06
decoys 104822 9.56 2.46 4jav AB:C 2c2a AB:AB 2.39 4ja2 A:C 0.45
decoys 221392 8.44 2.84 4jcv ABCD:E 1vdd ABCD:ABCD 1.59 1w3s A:E 1.35
decoys 129004 8.50 1.87 4jhp B:C 4jvf A:B 0.48 4jhn A:C 0.91
decoys 457 9.04 4.03 4jo9 AC:B 4jnu AB:AC 1.84 4jq5 A:B 3.51
decoys 27916 9.42 3.63 4jqw A:C 4e9m A:A 0.81 4xol A:C 0.59
decoys 18253 9.68 5.67 4jx1 A:C 3p6s A:A 0.45 1xlq A:C 0.42
decoys 32347 16.04 3.85 4k0v A:B 2gy5 A:A 1.17 4jyo A:B 0.51
decoys 84921 16.73 3.96 4k71 A:BC 1ha2 A:A 4.46 5bxf AB:BC 0.86
decoys 256450 4.91 1.97 4keh AB:D 1mkb AB:AB 0.62 2fad A:D 1.23
decoys 107602 43.51 3.82 4kfm B:ACEJ 1tbg A:B 0.93 3sya ABCD:ACEJ 0.80
decoys 191582 5.54 2.36 4ki1 AB:F 3h9y BA:AB 2.28 2h2r A:F 0.89
decoys 178918 8.84 2.16 4kr0 AC:B 1r9m AB:AC 0.61 4l3n A:B 0.85
decoys 233150 8.21 3.34 4kxz AB:IJ 2tgi AB:AB 1.26 3eo0 AB:IJ 1.27
decoys 162862 8.72 4.49 4kyi A:B 4akf A:A 2.23 1z0d A:B 1.06
decoys 90807 11.11 2.53 4l41 A:C 1a4v A:A 0.61 2ae7 A:C 0.39
decoys 245814 10.12 2.59 4lhu AB:DG 1zt4 AB:AB 1.07 4lfh AB:DG 1.22
decoys 116969 4.95 2.62 4lnu ABD:K 4drx ABC:ABD 0.65 1bg2 A:K 1.86
decoys 41348 12.64 2.99 4lrz A:FH 2btd A:A 0.58 4lrx AB:FH 2.64
decoys 26353 9.69 4.80 4lsx A:C 4lsa A:A 1.13 4lsc A:C 0.61
decoys 133519 9.30 4.53 4lw4 AB:D 4lw2 AB:AB 0.59 1ni7 A:D 1.77
decoys 272378 29.51 4.00 4lx0 A:B 1yzk A:A 1.33 4j5m A:B 1.08
decoys 75930 4.78 2.82 4m3k A:B 4blm A:A 0.47 4m3j A:B 1.78
decoys 169269 22.62 3.96 4m5z A:HL 3uyw A:A 0.61 4m5y AB:HL 1.86
decoys 172068 13.21 2.72 4m7l HL:T 4m7k AB:HL 1.07 1tfh A:T 1.09
decoys 93854 9.24 4.24 4mdk A:E 3rz3 A:A 0.91 1f9j A:E 0.60
decoys 58403 8.80 3.77 4mne BC:A 4ehe AB:BC 1.90 3eqg A:A 1.03
decoys 191600 5.23 1.87 4mrt A:C 1qr0 A:A 1.89 2md9 A:C 0.65
decoys 57182 6.88 2.96 4n6o A:B 4awb A:A 0.34 4n6m A:B 1.25
decoys 174498 11.92 3.00 4nbe ABC:E 1ww9 ABC:ABC 1.02 1vck A:E 0.52
decoys 14599 8.11 4.33 4nif AD:B 2wnt AB:AD 1.13 1gol A:B 1.95
decoys 86492 25.39 3.18 4nm8 ABCDEF:HL 1hge ABCDEF:ABCDEF 0.45 4nm4 AB:HL 0.61
decoys 39369 6.60 1.87 4nyi Q:S 4dlt A:Q 0.41 2ii0 A:S 2.86
decoys 222394 5.21 2.59 4nzl A:B 3q76 A:A 0.48 1yn4 A:B 0.76
decoys 287723 8.43 4.63 4o4b A:B 3q25 A:A 2.86 4o4f A:B 1.56
decoys 52618 19.14 3.72 4p2a A:B 2fau A:A 1.57 3qdo A:B 0.75
decoys 54583 4.67 2.69 4p4h EFGHUWX:MNOP 4nqk ABCDEFG:EFGHUWX 0.90 2ms7 ABCD:MNOP 2.97
decoys 154543 8.03 3.37 4p4q A:B 1dcc A:A 0.37 3tyi A:B 0.34
decoys 282895 18.47 3.59 4p69 B:CD 3eps A:B 1.03 1sjs AB:CD 1.06
decoys 270991 5.40 2.63 4pdc AB:E 1mpu AB:AB 0.82 4ffe A:E 1.04
decoys 21842 3.77 2.26 4pj2 A:D 3od9 A:A 0.49 3ayq A:D 0.84
decoys 77906 21.58 3.48 4pj8 AB:CD 5d7l AB:AB 1.42 4dzb AB:CD 1.11
decoys 52324 9.52 3.11 4pou A:B 1kf8 A:A 0.88 4poy A:B 1.70
decoys 67965 6.95 2.62 4pw9 A:B 4pw3 A:A 0.38 4pwa A:B 0.98
decoys 29032 7.20 2.85 4qd2 ABCD:E 4lo7 ABCD:ABCD 1.45 3lng A:E 1.50
decoys 227087 25.44 3.82 4qti HL:U 4qth AB:HL 0.93 3u74 A:U 1.28
decoys 270679 28.86 3.71 4r4f AR:HL 4k0a AB:AR 0.59 4r4b AB:HL 2.94
decoys 164507 8.38 4.04 4r62 A:B 1ayz A:A 0.62 4pih A:B 0.90
decoys 93468 16.75 3.89 4r9y BD:HL 1f9s AB:BD 1.35 4r97 AB:HL 1.97
decoys 219364 8.08 3.11 4rf0 A:B 4pt5 A:A 1.99 3hm3 A:B 0.57
decoys 47929 9.53 2.86 4rix A:B 4otw A:A 1.23 4lrm A:B 1.25
decoys 117367 12.72 3.32 4rws A:C 3oe8 A:A 3.00 1vmp A:C 2.22
decoys 107009 8.80 4.72 4s10 A:C 4s11 A:A 0.56 1kcq A:C 0.63
decoys 10144 12.60 3.43 4txv A:B 1jfu A:A 0.30 4w9z A:B 2.09
decoys 268648 11.53 3.85 4v2c A:B 4v2d A:A 0.10 4v2b A:B 0.06
decoys 289935 9.31 3.83 4wjg ABC:E 4x0l ABC:ABC 1.11 4x0j A:E 1.44
decoys 287113 7.43 2.95 4wlr AB:C 4wlq AB:AB 1.21 1d3z A:C 0.68
decoys 102890 9.34 5.10 4wm0 A:D 4wlz A:A 0.81 1edm A:D 2.36
decoys 269120 8.90 2.27 4wza ABCD:GH 1m1n ABCD:ABCD 0.25 1fp6 AB:GH 1.46
decoys 145374 9.41 3.46 4xhu C:D 4r5w A:C 0.68 4xht A:D 0.94
decoys 192694 7.19 2.14 4xig MNST:Q 4tqv ABCD:MNST 1.00 1j1n A:Q 0.64
decoys 15616 3.81 1.97 4xr8 AF:C 4giz AB:AF 2.33 3d07 A:C 0.79
decoys 53786 8.67 4.60 4xs0 B:A 1cbl A:B 0.82 3s48 A:A 1.33
decoys 236540 14.78 3.89 4y5o A:B 4ykd A:A 1.55 2jrh A:B 1.57
decoys 252152 20.60 3.90 4y7m A:C 4qgy A:A 0.37 4y7l A:C 0.91
decoys 83073 6.96 2.40 4yeb A:B 4rmk A:A 0.59 4v2e A:B 1.52
decoys 1171 2.89 1.43 4zfr A:B 4zd5 A:A 0.57 2znv A:B 0.60
decoys 165518 12.65 3.85 5aup BI:H 3vx3 AB:BI 1.70 3a43 A:H 2.64
decoys 199818 9.22 3.25 5bmu A:B 2uz8 A:A 0.71 5a34 A:B 0.77
decoys 116251 5.18 2.73 5bvp HL:I 4g5z AB:HL 1.16 21bi A:I 1.25
decoys 104636 4.76 1.51 5c3i I:JKL 1tey A:I 1.16 4uuz ABC:JKL 1.37
decoys 243529 21.90 3.31 5c7x A:HL 1csg A:A 0.96 5d7s AB:HL 3.16
decoys 67053 7.05 2.90 5cec A:B 3v39 A:A 0.91 5cea A:B 0.56
decoys 34796 9.51 3.77 5cra A:D 5crb A:A 0.64 3m3j A:D 0.74
decoys 196533 11.79 3.10 5cvo A:BC 5cvl A:A 1.28 5cvm AB:BC 1.03
decoys 10795 9.13 3.95 5e0k C:BD 1geq A:C 0.65 5dvz AB:BD 0.66
decoys 269933 23.84 2.81 5e8d A:HL 1k36 A:A 1.86 5az2 AB:HL 2.98
decoys 209558 20.33 3.94 5eg3 A:B 4j96 A:A 0.98 4k44 A:B 0.86
     

Legend

aDownload files are gzip compressed tar archives
bRank of near-native model
cLigand C-alpha RMSD between docking model and unbound-unbound complex
dInterface C-alpha RMSD between docking model and unbound-unbound complex
eUnbound chains (before colon) and corresponding Bound chains (after colon)